归档

NBCI BLAST可能会出现序列名称带有“PATCHES XXX”，例如“Homo sapiens chromosome 1 genomic patch of type NOVEL, GRCh38.p14 PATCHES HSCHR1_12_CTG3”。UCSC In-Silico PCR会出现类似“chr1_jh636052_fix”的序列名称。

带有UMI的RNA文库，用fastp过滤接头并去除UMI，但由于fastp不同版本差异，旧版本接头去除不干净，导致比对率下降。

paraphrase-multilingual-MiniLM-L12-v2和gte-Qwen2-7B-instruct用于癌种分类的测试

UCSC Jim Kent的BLAT和In-Silico PCR等软件下载

Hexo搭建博客常用的命令

bamdst的旧版本（21年9月，软件后来有更新，但版本号没变），统计的[Total] Raw Reads (All Reads)错误，导致某些情况下的比对率偏低，On Target Rate也会受影响。

Falco软件测试，主要看与FastQC的分析时间、结果一致性、报告界面的差异。

分别用samtools coverage和bedtools bedcov计算区域内的Reads数，得到的结果不一致。

sambamba flagstat统计结果格式和samtools flagstat不一样，没有Primary Mapped Reads

Docker Windows桌面端，删除容器后，占用空间没有释放