# BLAST
GRC patch解释
NBCI BLAST可能会出现序列名称带有“PATCHES XXX”,例如“Homo sapiens chromosome 1 genomic patch of type NOVEL, GRCh38.p14 PATCHES HSCHR1_12_CTG3”。UCSC In-Silico PCR会出现类似“chr1_jh636052_fix”的序列名称。
BLAST短序列比对没有结果
BLAST短序列比对hg19,没有比对结果。需要设置特定参数。
BLAST及NT库本地化
下载NCBI的NT数据库到服务器本地
Blast比对结果中输出物种信息
用TaxonKit、blastdbcmd、makeblastdb建立子库