# Samtools
samtools的coverage和bedcov结果不一致
分别用samtools coverage和bedtools bedcov计算区域内的Reads数，得到的结果不一致。
sambamba flagstat没有Primary Mapped Reads
sambamba flagstat统计结果格式和samtools flagstat不一样，没有Primary Mapped Reads
分别用samtools coverage和bedtools bedcov计算区域内的Reads数，得到的结果不一致。
sambamba flagstat统计结果格式和samtools flagstat不一样，没有Primary Mapped Reads